Técnica de secuenciación para el Virus del papiloma humano (VPH)

 La secuenciación de próxima generación (NGS) es una prueba molecular utilizada para la detección y genotipado del Virus del Papiloma Humano (VPH), un virus de ADN de doble hebra con más de 200 genotipos, algunos de alto riesgo oncogénico asociados al cáncer cervicouterino y a otros cánceres anogenitales y orofaríngeos. La identificación del genotipo de VPH es clave para evaluar el riesgo de progresión, apoyar el seguimiento epidemiológico y orientar decisiones clínicas.

La NGS permite identificar múltiples genotipos de VPH en una sola corrida, incluso en coinfecciones y en muestras de tejidos fijados en parafina. El procedimiento incluye la extracción de ADN, amplificación por PCR de regiones específicas, preparación de librerías, secuenciación masiva paralela y análisis bioinformático mediante comparación con bases de datos de referencia.

Los paneles dirigidos de NGS analizan regiones clave del genoma viral, principalmente los genes E6 y E7, oncogenes que inactivan los supresores tumorales p53 y Rb; el gen E2, cuya alteración se asocia con integración viral y mayor riesgo oncogénico; y el gen L1, útil para la identificación genotípica. Este enfoque permite detectar genotipos de alto riesgo como VPH 16 y 18, así como genotipos de bajo riesgo clínicamente relevantes, contribuyendo al diagnóstico y vigilancia del VPH.

Video obtenido de: https://www.youtube.com/watch?v=SiEA65G5ErY  

Referencias Bibliográficas:

1. Andersen K, Holm K, Tranberg M, Pedersen CL, Bønløkke S, Steiniche T, et al. Targeted Next Generation Sequencing for Human Papillomavirus Genotyping in Cervical Liquid-Based Cytology Samples. Cancers (Basel) [Internet]. 2022 [consultado 17 ene 2026];14(3):652. Disponible en: https://doi.org/10.3390/cancers14030652

2. Ambulos NP Jr, Schumaker LM, Mathias TJ, White R, Troyer J, Wells D, et al. Next-Generation Sequencing-Based HPV Genotyping Assay Validated in Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Oropharyngeal and Cervical Cancer Specimens. J Biomol Tech [Internet]. 2020 [consultado 17 ene 2026];27(2):46–52. Disponible en: https://doi.org/10.7171/jbt.16-2702-004